
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抵抗能力生物富集MHC非常融合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫细胞肽字段或英译后掩盖信息内容,提高基因测序的真实度,并采用De novo重头测序技術,不依赖现有数据库,更快通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且雄厚的数据表格了解內容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递癌症抗原的有效途径
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成功案例探讨
01 逻辑学习
经典文章小题目:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
刊发刊物:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)不是种核输送核蛋白,在癌症复发中长时间过形容,做以为良性肿瘤产生的带动问题。近年来,靶点XPO1的小原子正被用做药学防癌药剂。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫性肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 那种始于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 癌肿-免疫力的治疗
的文章主题 :Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
撤稿杂志期刊:Nature Communications IF:16.6 2023
恶劣胸膜间皮瘤(MPM)有的是种药效黑心的侵蚀性性肿癌。可能现阶段的诊治方案怎么写短缺药效,如此十分困难需要新的诊治机制。主要是因为其T细胞核浸润性,做者假定MPM有的是个适当的诊治性肝癌役苗的计划。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用根据质谱的免疫抗体肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶变胸膜间皮瘤免疫系统肽组学论文检测
03 革兰氏阴性菌mRNA肺炎疫苗开放
句子题目的:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
收录自媒体:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过源于质谱的免疫抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌感然的Hela组织组织细胞和HCT-116组织组织细胞中签定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱总结
天然天然免役系统抗体力肽组学是核核苷酸组学的一如何快速发展趋势的节点,它专注力于研究方案天然天然免役系统抗体力体系中由主耍策划 混溶性组合体(MHC)或人类白癌上皮内部核抗原(HLA)分子结构呈递的天然天然免役系统抗体力肽。这样天然天然免役系统抗体力肽是癌上皮内部核表皮呈递的肽段,要被T癌上皮内部核掌握,若想闪避天然天然免役系统抗体力生理特点反应。基本概念质谱的天然天然免役系统抗体力肽组学以及成為鉴定费结论MHC核蛋白酶呈递肽的金标策略,要可以直接鉴定费结论有所差异生理特点和疾病状况下有所差异策划 和癌上皮内部核多种类型中的天然天然免役系统抗体力肽组,列举片体瘤或类病毒沾染的癌上皮内部核。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的核蛋白组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免役肽组测试服务的,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,能最准确且会展示 天然免役肽队列,得知比较多非明显天然免役肽,自上而下挑选出安全新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
决定性论文资料
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y