
近日,长沙医科大生一是附加醫院王学浩工程院院士人员在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向药物力量排泄检测分析服务。
英语翻译主题词:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名宝贝标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客服公司:南京医科大学
探索建材:细胞
拜谱能提供售后服务:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向疗法精力新陈代谢组
新技术路线规划:
实验结论
01、YBX1被鉴定结论为HCC中糖酵解的要素基因组
本探讨获取HCC癌肿样版(n=7)的单神经癌肿内部RNA测序统计资料集实行统计数据解析,察觉到糖酵解活性酶类首要集结在癌肿神经癌肿内部中,hdWGCNA统计数据解析快速精确出9个人类基因摸块(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的生活工作统计数据解析确保YBX1为独立区域生活工作的风险影响(图1H)。继续骤融入IHC、WB进行实验和癌肿团队与最靠近非癌肿团队的区域转录组学统计资料集查证YBX1是肝神经癌肿内部癌开展的不确定性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被设定为调接HCC人体细胞糖酵解的重中之重各种因素
02、YBX1驱动HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法势能代谢转化组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1增进HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1切合并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1切合并利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化资料其磷碱化,最终得以提高网站其核转位
进1步的检测YBX1的O-GlcNAc糖基化需不需要应响其磷过酸,在OGT敲低的HCC人体组织细胞中或用OGT仰中药制剂OSMI-1治疗,YBX1核血清级别不错缩减,YBX1磷过酸不错可以减少(图4A-C)。IP科学实验体现 ,在重复的Flag-YBX1底物级别下,YBX1-WT的磷过酸级别不错如果超过YBX1-T57A,证实磷过酸的新增不仅是而是较高的YBX1核血清表示(图4D)。溶合了核和质混合物表明TMG治疗的HCC人体组织细胞中YBX1核表示的变高(图4E-F),进1步表明YBX1磷过酸的主要的调节细胞是AKT(图4G-I)。以下表明指出O-GlcNAc糖基化凭借促使其磷过酸来推进YBX1核血清稳固性并促使核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 绘制语有助于其进步骤發生磷过酸绘制语并就能够促使其核转位
05、YBX1利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1催进PKM2转录
06、YBX1 要能加快组球蛋白乳碱化呈现水平方向
科研得知YBX1敲低差异性削减蛋清质乳硝化成用,尤其是是H3K18乳硝化成用(图6A-C)。糖酵解减缓剂2-DG的实验性断定了糖酵解与组蛋清乳硝化成用的简单连接,减缓糖酵解可差异性削减H3K18la质量(图6D)。PKM2过传达不可逆转转YBX1敲低形成的H3K18la急剧下降,到外源乳酸正确处理一方面完善H3K18la,还随YBX1传达上涨,建议存在着正向着返馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la确认生物富集于YBX1重新启动子简单有利于其转录,该过程中受O-GlcNAc糖基化干预(图6H-J),并得知P300 上涨是YBX1增进H3K18乳酰化成用的缘由(图6K-L)。
图6.YBX1增強H3K18乳碱化呈现关卡
原创文章总结ppt
在这些的研究中曝光了YBX1在HCC中高展示,且与糖酵揭秘切想关。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,因而固定血清质并加入其展示。这些突显还有利于YBX1在T57处的磷过酸,有利于其核易位。那么,这种的时候促进了糖酵解想关dna的转录并的刺激乳酸的存在。凡此种种,YBX1刺激启动P300的转录,继而动力组血清的乳过酸,很大是H3K18la,H3K18乳过酸正向着调节作用YBX1dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因遗传规律正反面馈环原则图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向疗法人体脂肪代谢率组技术服务,拜谱微生物建立了完善成熟的转录组学、球蛋白组学、全文翻译后修饰语组学、排泄组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
学习文献综述
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.